Essa expressão vem de uma fábula de La Fontaine chamada "A Águia e a Coruja". Nessa fábula a coruja e a águia decidem fazer um acordo de paz. A águia pede para a coruja descrever como são seus filhotes para que ela não os devorasse por engano. Ao descrevê-los, a coruja fala que eles são entre outras maravilhas as coisas mais elegantes, e belas entre os bichos de penas. A águia é conhecida por ter uma excelente visão, e quando viu aqueles filhotes horríveis não pensou duas vezes e os devorou. Quando a coruja foi reclamar a águia pois a culpa nela mesma por não saber descrever corretamente seus filhotes.

Moral da história: toda vez que a gente chama uma pessoa de mãe coruja ou pai coruja, sem querer estamos falando que essa pessoa está exagerando as qualidades de seus filhos. 

Outra curiosidade relacionada a coruja:

Você sabia que a marca de sabão OMO significa Old Mother Owl (Velha Mãe Coruja)?

No início a marca tinha a imagem de uma coruja na embalagem onde os 'Os' representavam os olhos e o 'M' no meio seria o bico da coruja.

Antiga caixa de OMO. Note que os olhos e o bico formam a palavra OMO.